Desde el siglo XVI, en la Nueva España se construyeron una gran cantidad de órganos en su mayoría de tamaño mediano y se conservo mucho de la organeria española: los registros partidos, los medios registros, registros con adornos y mascarones en hoja de oro, las octavas cortas, las contras, etc., Pero ¿que hace realmente al órgano mexicano tan especial ? Hay muchos aspectos. Su sonido colorido y brillante expresa la gracia y calidez de la cultura mexicana. Sus cajas eran ricamente talladas y policromadas, y se crearon estilos definidos por épocas y regiones.

Aún con las antiguas raíces de la organería mexicana, esta se ha visto en un periodo de agonía por la introducción de órganos neumáticos de manufactura alemana y por la incorporación del "electrófono de plástico", mal llamado órgano electrónico. Este último ha sido mas aceptado entre las iglesias por su bajo costo y esto ha generado que muchos órganos mexicanos antiguos sean abandonados en vez de ser restaurados y que la construcción de estos sea muy escasa. Pero a pesar de que el órgano tubular ha sido modernizado con los avances tecnológicos ,la magia de los órganos hechos a mano por los artesanos mexicanos no podrá ser remplazada.